1981 yılında Körbling ve arkadaşları, HSC’lerin alternatif kaynağı olarak periferik stem cell (PSC)kullanımını tanımlamış ve klinik uygulaması gerçekleştirilmiştir. Malign bir hastalığa sahip olan şahıslarda yüksek doz kemoterapiden sonra ya da tek başına G-CSF veya GM-CSF ile stimule edilerek; çok sayıda hemopoetik stem cell in kemik iliği ortamından ayrılarak periferik sirkülasyona katıldıkları ve bir ya da daha çok aferez işlemi ile kolaylıkla toplanabildikleri bilinmektedir.

Stimule edilerek HSC lerin mobilize edildiği yer olarak periferik kan, neredeyse tamamiyle otolog transplantasyon için bir hücre kaynağı olarak ilik ile yer değiştirir . Bu işlemin avantajları, kolay toplama, transplantasyondan sonra çok daha hızlı engraftment ve potansiyel olarak daha az tümör kontaminasyonudur.

Üçüncü bir potansiyel HSC kaynağı ise 1988 yılında Gluckman ve arkadaşları tarafından, ilikten çok daha fazla konsantre primitif hücre içerdiği görülen umbilikal kordon kanının olduğunu bilidirmiştir. Doğum esnasında anneye veya yeni doğana zarar vermeksizin 250 mL’ye kadar toplanabilir.

Anrelated (akraba olmayan) allojenik transplantasyon konusunda, kordon kan bankası ile yeni bir devrim başlatılabilir umudu taşımakla birlikte kordon kanı yetişkin alıcılara güvenilir şekilde engraft etmek üzere yeterli miktarda HSC’ler içermeyebilir. Bunlarla birlikte son birkaç yılda ayrıca fetal kemik kavitesinden elde edilebilecek primitif hücrelerden de belki de daha az ve HLA uyumu aranmadan kemik iliği nakli veya organ naklinin oluşabileceğine dair bazı kanıtlar elde edilmiş ve çalışmalar bir çok laboratuarda yarışırcasına devam etmektedir

Gerçek transplantasyon prosedürü, toplanan stem cell konsantresinin intravenöz yolla infüzyonunudur. Birçok sağlık personeli bile bu prosedür hakkında belki de doğru bir bilgiye sahip değildir. Otolog kemik iliği veya periferik stem cell lerin kriopreservasyonu sırasında kullanılan dimethylsulfoxisol solüsyonu (DMSO), fazla bekletilmeden yapılan allojenik reinfüzyonlar çok iyi tolere edilebilmekle birlikte bazen orta derecede pulmoner ve sistemik toksisiteye neden olabilir.

HSC’ler, tam olarak anlaşılamamış olan mekanizmalar ile kemik iliği kavitesine kolayca yerleşmektedir, ve ilk nötrofillerin tutması için geçen 10 ila 25 günün ardından trombositler ve eritrositler de tutar. Bu, donör stem (kök) hücrelerinin engraftmentini (tutmasını) gösterir.